Business
Technology
合成生物学を用いた人工的なバイオプロセスの開発過程において、
上流の基礎研究部分を強みとして一貫した情報解析ソリューションを開発しています。
digzyme's Expertise
開発経験 酵素一覧:
CoA Ligases
Cyclases
Decarboxylases
Dehalogenases
Esterases
Glycosyltransferases
Hydrolases
Methyltransferases
Peroxidases (P450s)
Phosphotransferases
Polyketide synthases (PKSs)
Prenyltransferases
情報解析技術一覧:
Chemoinformatics
Retrosynthetic analysis
Reaction similarity search
Genomeinformatics
Sequence similarity search
Phylogenetic analysis
Metagenomic analysis
3D structure analysis
Homology modeling
de novo modeling
Ligand-enzyme docking
Polymer-enzyme docking
Molecular dynamics
Free energies calculations
QM/MM
Enzyme pocket prediction
Enzyme multimerization prediction
Enzyme Improvement
Codon optimization
Improved mutant prediction
Ancestral sequence reconstruction
Solutions
新規事業企画の方向け
事業戦略立案支援
例えば下記のような課題をお持ちの方はこちらからお問い合わせください。
- 石油化学由来製品のバイオ化を進めたい
- これからバイオプロセスを用いて新規事業を起こしたい
- 興味はあるが自社のどの事業に適用可能かを検討したい
バイオ系研究開発の方向け
遺伝子が未知の酵素反応に対して、有効な候補を提案します。
目的物までの反応経路が未同定の場合でも、開発目的(発酵法・酵素法+α)に合わせて順・逆合成による合成経路探索も組みわせて実施することができます。
事前情報無しで有効な変異体を予測することができます。
機械学習によって短時間で予測結果が得られるため、他の様々な指向性進化手法と合わせて実施することができます。例えば、活性中心に対するSite saturation mutagenesisなどが実施可能です。
(※本ソリューションは開発中のため、一部仕様が変更になる可能性があります)